12月13日,四川省畜牧科学研究院家禽研究团队发布了首款四川地方鸡专用基因芯片——“川芯一号”,该芯片的研发得到了国家现代农业产业技术体系建设专项、四川省畜禽育种攻关、四川省农业科学院原始创新2035等项目的长期资助,将为四川地方鸡种质资源的保护、开发、利用及育种技术的革新提供强有力的科技支撑,促进四川省养鸡产业更高水平发展。
四川是畜禽种业大省,拥有旧院黑鸡、乡城藏鸡、彭县黄鸡等国家级鸡遗传资源14个,因肉蛋品质鲜美、营养价值高、适应性强等特点,受到养殖户、消费者喜爱。四川地方鸡保种育种长期依赖于表型选择,缺乏精准高效、低成本的分子工具,因此存在种质混杂、优良性状退化等现象,加上效率低、周期长,难以满足四川省鸡产业发展现实需求。而高密度、低成本的基因芯片技术能够快速、准确地检测出与重要经济性状相关的基因,从而提高保种效率并加速优良品种的选育进程。
“川芯一号”基因芯片依托团队前期积累的丰富实践经验和海量数据,利用国内生物种业龙头企业华智生物自主研发的cGPS靶向测序分型技术,基于四川14个地方鸡种的全基因组重测序数据,优选代表性强、多态性高、通用性好的SNP位点10 075个,筛选出品种特异位点1 590个,并整合与鸡体重、产蛋、酮体、肌肉发育、采食量、开产日龄、饲料转化率、胸肌重、平均日增重、股骨长、鸡冠形态、繁殖、疾病等169个性状相关的QTL位点1 900个,基本涵盖了四川地方鸡种质溯源、资源鉴定、重要经济性状选育等内容,可应用于四川地方鸡资源的精准鉴定及优势特色性状基因的挖掘与功能分析,目标位点检出率达99.9%、分型结果重复一致率达99.8%,对于加速优良品种的培育和开发进程,有效破解四川地方鸡良种不能自给、良繁体系不健全、生产性能不稳定等瓶颈,从而促进四川地方鸡产业更高水平发展提供了强有力的支撑。
接下来,团队将加大宣传推广力度,将“川芯一号”尽快运用于四川地方鸡保种、精准高效育种等领域,进而助力四川乡村特色产业发展。
